| 名称 | 路線名 | 延長 | 竣工年 | 所在地 | 位置 |
| 藤崎台隧道 | 182 | 1975 | 熊本県熊本市 | [mapion] | |
| 東間赤池隧道 | 47 | 1909 | 熊本県人吉市 | [mapion] | |
| 古仏頂大野隧道 | 126 | 1909 | 熊本県人吉市 | [mapion] | |
| 通山トンネル | 203 | 1989 | 熊本県本渡市 | [mapion] | |
| 鯔山隧道 | 80 | − | 熊本県牛深市 | [mapion] | |
| 第一堀切隧道 | 17 | 1900 | 熊本県菊池市−菊鹿町 | [mapion] | |
| 第二堀切隧道 | 16 | 1900 | 熊本県菊池市 | [mapion] | |
| 第三堀切隧道 | 8 | 1916 | 熊本県菊池市 | [mapion] | |
| 第四堀切隧道 | 7 | 1916 | 熊本県菊池市 | [mapion] | |
| 第五堀切(太田)隧道 | 109 | 1916 | 熊本県菊池市−山鹿市(菊鹿町) | [mapion] | |
| 堀切隧道 | − | − | 熊本県菊池市 | [mapion] | |
| 中片トンネル | 150 | 1987 | 熊本県菊池市 | [mapion] | |
| 下半尺トンネル | 137 | 1989 | 熊本県菊池市 | [mapion] | |
| 平隧道 | 30 | 1961 | 熊本県上天草市 | [mapion] | |
| 二弁当隧道 | 49 | 1935 | 熊本県上天草市 | [mapion] | |
| 姫浦隧道 | 9 | 1941 | 熊本県上天草市 | [mapion] | |
| 手場隧道 | 35 | 1903 | 熊本県宇土郡三角町 | [mapion] | |
| 新道隧道 | 80 | 不明 | 熊本県下益城郡小川町 | [mapion] | |
| 打越トンネル | 107 | 不明 | 熊本県下益城郡砥用町 | [mapion] | |
| 船津隧道 | 39 | 1893 | 熊本県下益城郡砥用町 | [mapion] | |
| 峙原隧道 | 30 | 1956 | 熊本県下益城郡砥用町 | [mapion] | |
| 戸ノ下隧道 | 6 | 1898 | 熊本県下益城郡砥用町 | [mapion] | |
| 洞岳隧道 | 142 | 1968 | 熊本県下益城郡砥用町 | [mapion] | |
| 内大臣第一隧道 | 18 | 1995 | 熊本県下益城郡砥用町 | [mapion] | |
| 内大臣第二隧道 | 28 | 1995 | 熊本県下益城郡砥用町 | [mapion] | |
| 由比トンネル | 20 | 1925 | 熊本県下益城郡砥用町 | [mapion] | |
| 松風トンネル | 173 | 1938 | 熊本県玉名郡南関町 | [mapion] | |
| 鬼王隧道 | 85 | 1955 | 熊本県玉名郡南関町 | [mapion] | |
| 若宮原隧道 | 45 | 1979 | 熊本県鹿本郡菊鹿町 | [mapion] | |
| 手形野隧道 | 75 | 1968 | 熊本県阿蘇郡南小国町 | [mapion] | |
| きよらトンネル | 210 | 1998 | 熊本県阿蘇郡南小国町 | [mapion] | |
| 満願寺隧道 | 81 | 不明 | 熊本県阿蘇郡南小国町 | [mapion] | |
| 向鶴第一隧道 | 町道対岸線 | 23 | 1930 | 熊本県阿蘇郡小国町 | [mapion] |
| 向鶴第二隧道 | 町道対岸線 | 19 | 1930 | 熊本県阿蘇郡小国町 | [mapion] |
| 切通トンネル | 203 | 1989 | 熊本県阿蘇郡小国町 | [mapion] | |
| *上田隧道 | - | - | 熊本県阿蘇郡小国町 | [mapion] | |
| 別所トンネル | 115 | 1994 | 熊本県阿蘇郡小国町 | [mapion] | |
| 中山鹿トンネル | 40 | 1979 | 熊本県阿蘇郡産山村 | [mapion] | |
| 奥畑第一トンネル | 140 | 1950 | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 奥畑第二トンネル | 77 | − | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 甲間トンネル | 116 | − | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 攪上トンネル | 21 | 1966 | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 麻山隧道 | 44 | 1950 | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 七曲トンネル | 69 | 不明 | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 柚木トンネル | 20 | 1978 | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 野尻隧道 | 97 | 1952 | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 中川隧道 | 60 | 1950 | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 上菅隧道 | 40 | 1951 | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 園目隧道 | 46 | 1969 | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 皿木隧道 | 67 | 1952 | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 荒谷隧道 | 47 | 1940 | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 中の原トンネル | 117 | − | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 御所トンネル | 312 | 1980 | 熊本県上益城郡矢部町 | [mapion] | |
| 滝下隧道 | 20 | 1956 | 熊本県上益城郡清和村 | [mapion] | |
| 小中竹隧道 | 57 | 1959 | 熊本県上益城郡清和村 | [mapion] | |
| 楢原隧道 | 30 | 1957 | 熊本県上益城郡清和村 | [mapion] | |
| 法連寺隧道 | 36 | 1930 | 熊本県上益城郡清和村 | [mapion] | |
| にちこう隧道 | 41 | 1985 | 熊本県八代郡坂本村 | [mapion] | |
| 大平隧道 | 229 | 1971 | 熊本県八代郡坂本村 | [mapion] | |
| 不明 | 80 | 1986 | 熊本県八代郡泉村 | [mapion] | |
| 佐敷隧道 | 245 | 1993 | 熊本県葦北郡芦北町 | [mapion] | |
| 津奈木隧道 | 211 | 1962 | 熊本県葦北郡津奈木町 | [mapion] | |
| 長岡隧道 | 61 | − | 熊本県球磨郡湯前町 | [mapion] | |
| 牧島トンネル | 175 | − | 熊本県天草郡御所浦町 | [mapion] | |
| 長浦トンネル | 194 | 2000 | 熊本県天草郡御所浦町 | [mapion] | |
| 第一隧道 | 118 | − | 熊本県天草郡五和町 | [mapion] | |
| 第二隧道 | 244 | − | 熊本県天草郡五和町 | [mapion] | |
| 第三隧道 | 176 | − | 熊本県天草郡五和町 | [mapion] | |
| ゆきあいトンネル | 57 | − | 熊本県天草郡天草町 | [mapion] | |
| 高浜トンネル | 90 | − | 熊本県天草郡天草町 | [mapion] | |
| 千通トンネル | 100 | 1936 | 熊本県天草郡天草町 | [mapion] | |
| 白木隧道 | 白木河内西高根線 | 239 | 1971 | 熊本県天草郡河浦町 | [mapion] |
| 平成トンネル | 白木河内西高根線 | 413 | 2000 | 熊本県天草郡河浦町 | [mapion] |
| 宇土崎隧道 | 39 | 1939 | 熊本県天草郡河浦町 | [mapion] | |
| 番所隧道 | 15 | 1953 | 熊本県天草郡河浦町 | [mapion] |
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